Hindari memasak labu siam terlalu lama karena bisa mengurangi kadar vitamin di dalamnya. Labu siam bisa diolah dengan cara ditumis ringan, direbus sebentar untuk lalapan, atau dijadikan campuran sayur berkuah.
Untuk manfaat maksimal, sebaiknya labu siam tidak dimasak dengan terlalu banyak minyak atau santan yang berlebihan.
Mengombinasikan labu siam dengan sayuran lain seperti wortel, bayam, atau jagung manis juga akan membuat hidangan lebih kaya nutrisi.